দীর্ঘ নয় মাস সশস্ত্র মুক্তিযুদ্ধের পর ১৯৭১ সালের ১৬ই ডিসেম্বর পৃথিবীর মানচিত্রে বাংলাদেশ একটি স্বাধীন ও সার্বভৌম রাষ্ট্র হিসেবে প্রতিষ্ঠিত হয়। তত্কা‌লীন রেল, নৌ ও সড়ক  পরিবহন খাতের সমন্বয়ে যোগাযোগ মন্ত্রণালয় সৃষ্টি হয়। পরবর্তী সময়ে যোগাযোগ মন্ত্রণালয়ের কার্যপরিধি বৃদ্ধি পাওয়ায় জাতীয় স্বার্থে যোগাযোগ মন্ত্রণালয়কে পুনর্বিন্যাসপূর্বক বন্দর, জাহাজ চলাচল ও অভ্যন্তরীণ নৌ-পরিবহন মন্ত্রণালয় প্রতিষ্ঠা করা হয়। ১৯৮৮ সালের জানুয়ারি মাসে বন্দর, জাহাজ চলাচল ও অভ্যন্তরীণ নৌ-পরিবহন মন্ত্রণালয়কে ‘‘নৌ-পরিবহন মন্ত্রণালয়’’ হিসেবে নামকরণ করা হয়।

• নদী বন্দর, সমুদ্র বন্দর ও স্থল বন্দরসমূহের ব্যবস্থাপনা, বাতিঘর ও বয়াবাতি ব্যবস্থাপনা, উন্নয়ন ও সংরক্ষণ; 
• নাব্যতা রক্ষাকল্পে নৌ পথ ড্রেজিং, নিরাপদ নৌ-চলাচলের জন্য বয়া লাইটেড নির্দেশিকা ও পিসি পোল স্থাপন;
• নৌ বাণিজ্য সম্প্রসারণ ও সহযোগিতা;
• অভ্যন্তরীণ নৌপরিবহন ও জাহাজ চলাচল, মেরিন সার্ভিসেস এবং নিরাপদ নৌ চলাচল নিশ্চিতকরণ; 
• অভ্যন্তরীণ নৌ পথের নাব্যতা উন্নয়ন ও সংরক্ষণ;
• যান্ত্রিক নৌ যান ব্যবস্থাপনা ও নিয়ন্ত্রণ, নৌ যান সার্ভে ও রেজিস্ট্রেশন;
• সামুদ্রিক জাহাজ চলাচল ও নেভিগেশন; নৌ বাণিজ্য, জাহাজ সম্পর্কিত প্রয়োজনীয় শিক্ষা ও প্রশিক্ষণ;
• মূল ভূখন্ড ও দ্বীপসমূহের মধ্যে এবং অভ্যন্তরীণ নৌ-চলাচল ব্যবস্থাপনা ও রক্ষণাবেক্ষণ;
• মন্ত্রণালয় সম্পর্কিত বিষয়াদি সমন্বয় ও গবেষণা;
• জাহাজ চলাচল ও নেভিগেশন সম্পর্কিত আইন-বিধি প্রণয়ন; 
• আন্তর্জাতিক সংস্থাসমূহের সাথে যোগাযোগ এবং বিভিন্ন দেশ ও বিশ্ব সংস্থার (IMO, IOPC ইত্যাদি) সাথে চুক্তি ও স্মারক সম্পর্কিত বিষয়াদি;
• আদালতে গৃহীত ফি ব্যতীত মন্ত্রণালয়ের আওতাভুক্ত কার্যক্রম সংশ্লিষ্ট বিভিন্ন চার্জ সম্পর্কিত বিষয়াদি;